Das Hamburger Spendenparlament ist als Verein organisiert, in dem das Mitglieder-Parlament von der Satzung her ein „Beirat“ ist. Dieser Beirat von derzeit rund 3.100 Mitgliedern hat die volle Entscheidungsbefugnis über die Vergabe der Mittel und ist dabei lediglich an die Satzung gebunden.
Damit diese beispielhaft demokratische Form der Mitbestimmung möglich ist, und das Spendenparlament seinen gemeinnützigen Auftrag wirksam erfüllen kann, gruppieren sich um das Parlament drei Gremien und zwei Ausschüsse: Präsidium, Vorstand und Finanzkommission sowie der Ausschuss für Büro- und Mitgliederbetreuung bzw. PR- und Öffentlichkeitsarbeit.
Unterstützt durch Förderer und Partner, übernehmen die ehrenamtlichen Mitarbeiter der beiden Ausschüsse sämtliche geschäftlichen, organisatorischen und kommunikativen Aufgaben für das Hamburger Spendenparlament bzw. die Gesamtheit aller Parlamentarier.